Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD39Q53RE8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD39Q53RE8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD39Q53RE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms