Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD4Q53EL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD4Q53EL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD4Q53EL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms