Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNF212Q495C1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms