Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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