Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF239Q16600 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF239Q16600 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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