Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYPL1Q16563 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYPL1Q16563 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms