Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPE65Q16518 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPE65Q16518 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPE65Q16518 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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