Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHBQ15464 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHBQ15464 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHBQ15464 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHBQ15464 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SHBQ15464 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHBQ15464 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHBQ15464 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHBQ15464 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHBQ15464 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHBQ15464 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHBQ15464 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHBQ15464 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHBQ15464 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHBQ15464 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHBQ15464 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHBQ15464 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBQ15464 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBQ15464 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBQ15464 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBQ15464 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBQ15464 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHBQ15464 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHBQ15464 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBQ15464 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBQ15464 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBQ15464 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBQ15464 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBQ15464 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHBQ15464 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHBQ15464 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms