Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B3Q15393 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SF3B3Q15393 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SF3B3Q15393 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SF3B3Q15393 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms