Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCM1Q15154 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCM1Q15154 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCM1Q15154 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCM1Q15154 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCM1Q15154 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCM1Q15154 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCM1Q15154 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCM1Q15154 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
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