Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HERPUD1Q15011 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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