Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD4Q14CM0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD4Q14CM0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD4Q14CM0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms