Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCINQ13939 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCINQ13939 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCINQ13939 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCINQ13939 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCINQ13939 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCINQ13939 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCINQ13939 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCINQ13939 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCINQ13939 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCINQ13939 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCINQ13939 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCINQ13939 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCINQ13939 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCINQ13939 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCINQ13939 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCINQ13939 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCINQ13939 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCINQ13939 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCINQ13939 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCINQ13939 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCINQ13939 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCINQ13939 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCINQ13939 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCINQ13939 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCINQ13939 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCINQ13939 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCINQ13939 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCINQ13939 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCINQ13939 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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