Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EXOSC2Q13868 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC2Q13868 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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