Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMAD4Q13485 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMAD4Q13485 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMAD4Q13485 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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