Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2V1Q13404 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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UBE2V1Q13404 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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UBE2V1Q13404 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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UBE2V1Q13404 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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UBE2V1Q13404 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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UBE2V1Q13404 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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UBE2V1Q13404 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2V1Q13404 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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