Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK5R2Q13319 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5R2Q13319 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms