Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXC1Q12948 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXC1Q12948 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXC1Q12948 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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