Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCB1Q12824 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMARCB1Q12824 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCB1Q12824 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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