Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TFCP2Q12800 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFCP2Q12800 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFCP2Q12800 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TFCP2Q12800 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TFCP2Q12800 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TFCP2Q12800 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFCP2Q12800 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TFCP2Q12800 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
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