Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2orf54Q08AI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C2orf54Q08AI8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2orf54Q08AI8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms