Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT17Q04695 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT17Q04695 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT17Q04695 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms