Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP2Q03169 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP2Q03169 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP2Q03169 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms