Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CREMQ03060 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CREMQ03060 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREMQ03060 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREMQ03060 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREMQ03060 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CREMQ03060 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREMQ03060 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CREMQ03060 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CREMQ03060 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREMQ03060 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREMQ03060 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREMQ03060 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREMQ03060 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CREMQ03060 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREMQ03060 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CREMQ03060 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREMQ03060 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREMQ03060 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CREMQ03060 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREMQ03060 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CREMQ03060 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREMQ03060 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREMQ03060 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREMQ03060 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREMQ03060 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREMQ03060 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREMQ03060 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms