Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HSF1Q00613 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HSF1Q00613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms