Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2BQ00403 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2BQ00403 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2BQ00403 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2BQ00403 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2BQ00403 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF2BQ00403 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms