Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HBBP68871 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HBBP68871 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HBBP68871 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HBBP68871 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HBBP68871 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HBBP68871 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HBBP68871 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HBBP68871 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HBBP68871 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms