Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP46P62068 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP46P62068 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP46P62068 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP46P62068 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP46P62068 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP46P62068 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP46P62068 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP46P62068 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP46P62068 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP46P62068 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP46P62068 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP46P62068 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP46P62068 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP46P62068 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP46P62068 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP46P62068 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP46P62068 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms