Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V0D1P61421 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V0D1P61421 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V0D1P61421 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms