Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNAP25P60880 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAP25P60880 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms