Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHBDL3P58872 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDL3P58872 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RHBDL3P58872 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDL3P58872 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDL3P58872 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDL3P58872 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHBDL3P58872 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDL3P58872 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDL3P58872 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDL3P58872 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDL3P58872 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDL3P58872 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDL3P58872 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDL3P58872 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms