Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSX2P58304 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSX2P58304 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSX2P58304 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSX2P58304 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSX2P58304 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSX2P58304 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSX2P58304 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSX2P58304 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSX2P58304 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSX2P58304 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSX2P58304 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSX2P58304 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSX2P58304 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSX2P58304 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSX2P58304 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSX2P58304 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSX2P58304 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSX2P58304 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSX2P58304 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSX2P58304 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSX2P58304 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSX2P58304 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSX2P58304 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSX2P58304 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSX2P58304 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSX2P58304 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX2P58304 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX2P58304 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX2P58304 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSX2P58304 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSX2P58304 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSX2P58304 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSX2P58304 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSX2P58304 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSX2P58304 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VSX2P58304 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms