Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJA9P57773 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJA9P57773 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA9P57773 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA9P57773 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJA9P57773 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJA9P57773 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA9P57773 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA9P57773 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA9P57773 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA9P57773 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA9P57773 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA9P57773 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA9P57773 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA9P57773 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA9P57773 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA9P57773 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA9P57773 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA9P57773 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA9P57773 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA9P57773 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA9P57773 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA9P57773 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA9P57773 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA9P57773 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA9P57773 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA9P57773 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms