Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC8A3P57103 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC8A3P57103 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms