Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX4P57082 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX4P57082 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX4P57082 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBX4P57082 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX4P57082 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX4P57082 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX4P57082 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX4P57082 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX4P57082 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX4P57082 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX4P57082 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBX4P57082 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX4P57082 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX4P57082 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX4P57082 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX4P57082 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX4P57082 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX4P57082 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX4P57082 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX4P57082 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX4P57082 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX4P57082 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX4P57082 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX4P57082 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX4P57082 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX4P57082 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX4P57082 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX4P57082 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX4P57082 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX4P57082 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX4P57082 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms