Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCKAP1LP55160 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKAP1LP55160 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms