Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGGTBP53611 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RABGGTBP53611 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGGTBP53611 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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