Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLK3P49761 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK3P49761 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK3P49761 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK3P49761 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK3P49761 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK3P49761 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLK3P49761 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLK3P49761 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLK3P49761 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLK3P49761 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK3P49761 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK3P49761 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK3P49761 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK3P49761 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLK3P49761 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLK3P49761 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLK3P49761 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLK3P49761 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLK3P49761 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK3P49761 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms