Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK1EP49674 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK1EP49674 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSNK1EP49674 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms