Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX1P48742 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LHX1P48742 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHX1P48742 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHX1P48742 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX1P48742 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX1P48742 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX1P48742 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LHX1P48742 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHX1P48742 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX1P48742 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHX1P48742 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHX1P48742 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX1P48742 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHX1P48742 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHX1P48742 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHX1P48742 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX1P48742 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX1P48742 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX1P48742 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX1P48742 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHX1P48742 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms