Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AMTP48728 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMTP48728 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMTP48728 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMTP48728 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AMTP48728 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMTP48728 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMTP48728 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AMTP48728 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AMTP48728 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AMTP48728 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms