Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRA4P48169 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms