Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGRP47804 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGRP47804 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGRP47804 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGRP47804 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGRP47804 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGRP47804 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGRP47804 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGRP47804 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RGRP47804 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGRP47804 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGRP47804 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGRP47804 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGRP47804 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGRP47804 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGRP47804 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGRP47804 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGRP47804 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGRP47804 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGRP47804 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGRP47804 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGRP47804 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGRP47804 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms