Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A4P43007 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A4P43007 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms