Protein–RNA interactions for Protein: P40003

VAB2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit VAB2, yeastyeast

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAB2P40003 HRR25YPL204W 1485 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 TAH18YPR048W 1872 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 BUD9YGR041W 1644 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 HSP104YLL026W 2727 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 DBR1YKL149C 1218 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 PRS1YKL181W 1284 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 SFT2YBL102W 648 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 HXT4YHR092C 1731 nt5.45□□□□□ -1.54
VAB2P40003 MCM6YGL201C 3054 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 DDC1YPL194W 1839 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 GLT1YDL171C 6438 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 DNF2YDR093W 4839 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 VMS1YDR049W 1899 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YDR396WYDR396W 501 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 APS1YLR170C 471 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 GDT1YBR187W 843 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 OXP1YKL215C 3861 nt5.44□□□□□ -1.54
VAB2P40003 ALD6YPL061W 1503 nt5.43□□□□□ -1.54
VAB2P40003 CST6YIL036W 1764 nt5.43□□□□□ -1.54
VAB2P40003 SPR6YER115C 576 nt5.43□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YNK1YKL067W 462 nt5.43□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YNL134CYNL134C 1131 nt5.43□□□□□ -1.54
VAB2P40003 PDR10YOR328W 4695 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 COX17YLL009C 210 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YTH1YPR107C 627 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 SUE1YPR151C 621 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YIR007WYIR007W 2295 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 SWI3YJL176C 2478 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 FUI1YBL042C 1920 nt5.42□□□□□ -1.54
VAB2P40003 TFC6YDR362C 2019 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 UGA2YBR006W 1494 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YBL010CYBL010C 843 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 URE2YNL229C 1065 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 AIF1YNR074C 1137 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 RPO26YPR187W 468 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 BUD7YOR299W 2241 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 RCK1YGL158W 1539 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 SIF2YBR103W 1608 nt5.41□□□□□ -1.54
VAB2P40003 TBF1YPL128C 1689 nt5.4□□□□□ -1.54
VAB2P40003 PUT1YLR142W 1431 nt5.4□□□□□ -1.54
VAB2P40003 SCM3YDL139C 672 nt5.4□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YDR133CYDR133C 336 nt5.4□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YGL088WYGL088W 366 nt5.4□□□□□ -1.54
VAB2P40003 YKR041WYKR041W 753 nt5.4□□□□□ -1.54
VAB2P40003 PRR1YKL116C 1557 nt5.4□□□□□ -1.55
VAB2P40003 YEH2YLR020C 1617 nt5.4□□□□□ -1.55
VAB2P40003 LPL1YOR059C 1353 nt5.4□□□□□ -1.55
VAB2P40003 GWT1YJL091C 1473 nt5.39□□□□□ -1.55
VAB2P40003 NQM1YGR043C 1002 nt5.39□□□□□ -1.55
VAB2P40003 EPS1YIL005W 2106 nt5.39□□□□□ -1.55
VAB2P40003 HXT5YHR096C 1779 nt5.39□□□□□ -1.55
VAB2P40003 UTP9YHR196W 1728 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 YNL174WYNL174W 573 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 RGS2YOR107W 930 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ODC2YOR222W 924 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 KDX1YKL161C 1302 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 RAT1YOR048C 3021 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ERG4YGL012W 1422 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ROG3YFR022W 2202 nt5.38□□□□□ -1.55
VAB2P40003 SSZ1YHR064C 1617 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 NGR1YBR212W 2019 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 RHO3YIL118W 696 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 CCZ1YBR131W 2115 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ALD3YMR169C 1521 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ALD2YMR170C 1521 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ELP3YPL086C 1674 nt5.37□□□□□ -1.55
VAB2P40003 THI5YFL058W 1023 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 YHR140WYHR140W 720 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 THI12YNL332W 1023 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 YJR124CYJR124C 1347 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 MKS1YNL076W 1755 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 OPT1YJL212C 2400 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 APC1YNL172W 5247 nt5.36□□□□□ -1.55
VAB2P40003 NOP2YNL061W 1857 nt5.35□□□□□ -1.55
VAB2P40003 MMT2YPL224C 1455 nt5.35□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ASA1YPR085C 1332 nt5.35□□□□□ -1.55
VAB2P40003 NCS6YGL211W 1080 nt5.35□□□□□ -1.55
VAB2P40003 ACP1YKL192C 378 nt5.35□□□□□ -1.55
VAB2P40003 MRI1YPR118W 1236 nt5.35□□□□□ -1.55
VAB2P40003 RIM15YFL033C 5313 nt5.34□□□□□ -1.55
VAB2P40003 RPT2YDL007W 1314 nt5.34□□□□□ -1.55
VAB2P40003 SEC17YBL050W 879 nt5.34□□□□□ -1.55
VAB2P40003 POR1YNL055C 852 nt5.34□□□□□ -1.55
VAB2P40003 SFB3YHR098C 2790 nt5.33□□□□□ -1.56
VAB2P40003 GRS1YBR121C 2004 nt5.33□□□□□ -1.56
VAB2P40003 YAR023CYAR023C 540 nt5.33□□□□□ -1.56
VAB2P40003 PUS5YLR165C 765 nt5.33□□□□□ -1.56
VAB2P40003 YPR071WYPR071W 636 nt5.33□□□□□ -1.56
VAB2P40003 ADE3YGR204W 2841 nt5.33□□□□□ -1.56
VAB2P40003 MRF1YGL143C 1242 nt5.32□□□□□ -1.56
VAB2P40003 YNL181WYNL181W 1224 nt5.32□□□□□ -1.56
VAB2P40003 ISU2YOR226C 471 nt5.32□□□□□ -1.56
VAB2P40003 TNA1YGR260W 1605 nt5.32□□□□□ -1.56
VAB2P40003 SIT1YEL065W 1887 nt5.32□□□□□ -1.56
VAB2P40003 FUM1YPL262W 1467 nt5.32□□□□□ -1.56
VAB2P40003 MAG2YLR427W 2013 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms