Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL3P39023 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL3P39023 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL3P39023 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL3P39023 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL3P39023 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL3P39023 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL3P39023 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL3P39023 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL3P39023 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL3P39023 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL3P39023 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL3P39023 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL3P39023 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms