Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGCXP38435 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGCXP38435 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGCXP38435 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGCXP38435 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGCXP38435 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGCXP38435 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGCXP38435 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGCXP38435 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGCXP38435 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGCXP38435 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGCXP38435 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGCXP38435 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGCXP38435 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGCXP38435 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGCXP38435 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGCXP38435 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGCXP38435 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGCXP38435 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGCXP38435 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GGCXP38435 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGCXP38435 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GGCXP38435 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGCXP38435 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGCXP38435 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGCXP38435 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms