Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FDFT1P37268 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FDFT1P37268 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FDFT1P37268 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms