Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA11P31270 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA11P31270 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms