Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP1P29466 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP1P29466 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP1P29466 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP1P29466 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP1P29466 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP1P29466 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP1P29466 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASP1P29466 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASP1P29466 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASP1P29466 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP1P29466 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP1P29466 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP1P29466 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASP1P29466 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASP1P29466 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASP1P29466 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASP1P29466 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASP1P29466 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP1P29466 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP1P29466 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASP1P29466 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASP1P29466 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASP1P29466 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms